아마 현재 학생이 말씀하신 것 처럼 의공학 분야를 학부(과)과정으로 포함시키고 있는 곳이 많지 않은 것으로 알고 있습니다.
그래서 한양대 홈페이지를 우선적으로 참고하시라고 링크를 드립니다.

http://bme.hanyang.ac.kr/

이 곳에 교수님들이 어떤 학부(과)과정을 거치셨는지 나오는 데 학생이 말씀하신 것처럼 전기과도, 의예, 기계도 있습니다.
(화공은 정확하게 어떤 분야가 의공학과 연계가 있는지 제가 잘 모르겠습니다.ㅎㅎ;)

물론, 과거와 미래의 차이는 있겠지만 우리나라에서 현재 의공학을 연구하고 계신 교수님들의 걸어오신 길(?)을 보면 그 시작의 선택으로 인한 불리함은 학생이 우려하는 것 만큼 크지 않다고 생각합니다.

또한, 의공학을 함에 있어서도 훗날 학생이 심화적으로 원하는 분야가 기계적인 시스템의 구현인지, 혹은 신경과 센서를 이어주는 회로에 관한 것인지, 아니면 그러한 것들을 구현할 수 있는 재료에 관한 것인지 등 더 자세하고 심도 깊은 분야들이 무궁무진할 것 같다고 판단됩니다.

의공학 분야가 응용분야인만큼 단일 학문의 지식 보다는 다수 공학분야가 접목되어야 완성될 수 있는 분야라고 생각하기에
저 개인적으로는 시작의 선택으로 인한 유불리가 크지 않다고 판단이 됩니다.

p.s) 시간이 있다면 앞서 드린 링크에 나온 교수님들의 연구실 홈페이지에 들어가보면 교수님들의 메일주소 같은 것들이 있을 것입니다.
교수님들 께서 방학 중이라도 워낙 업무가 많으셔서 답변을 받기 어려울 수도 있겠지만, 여러 교수님들 께 메일로 질문해본다면 혹여 한 두 통이라도 답메일을 받아 더 정확한 대답을 얻을 수 있지 않을까 생각이 듭니다.ㅎ